El centro de documentación del Museo de La Salle Bogotá está compuesto por un acervo bibliográfico y documental de trascendencia histórica. Está conformado por dos grandes unidades: La Biblioteca especializada en Ciencias Naturales y el Fondo Histórico. 

EL Fondo Histórico está compuesto por los manuscritos elaborados por los Hnos.donde se recogen apúntes sobre las expediciones realizadas e información de los ejemplares colectados. En este lugar también se conserva material bibliográfico en áreas como la botánica, zoología, geología, mineralogía, paleontología, etología, biodiversidad,  taxidermia, museología.